［MySQLウォッチ］第45回 MySQL 5.1で強化されたログ機能
http://itpro.nikkeibp.co.jp/article/COLUMN/20090923/337679/
MySQL5.1ではログ機能が強化されているようです。
スロークエリー・ログ（処理に時間がかかったSQL文）を自動で記録してくれる機能も強化されています。
SQLは書き方によっては処理時間が大きく変わる為、
時間のかかっているSQLをチューニングすることによって、
パフォーマンスを改善することが出来ます。